Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE3

Rcor1, REST corepressor 1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcor1Q8CFE3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcor1Q8CFE3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rcor1Q8CFE3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rcor1Q8CFE3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rcor1Q8CFE3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rcor1Q8CFE3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rcor1Q8CFE3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rcor1Q8CFE3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rcor1Q8CFE3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rcor1Q8CFE3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcor1Q8CFE3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rcor1Q8CFE3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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