Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Klhl11Q8CE33 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Klhl11Q8CE33 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms