Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam228aQ8CDW1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam228aQ8CDW1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms