Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc63Q8CDV6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc63Q8CDV6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms