Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc178Q8CDV0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc178Q8CDV0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms