Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rassf4Q8CB96 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms