Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ubqln3Q8C5U9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubqln3Q8C5U9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms