Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc113Q8C5T8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms