Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5S3

Uncharacterized protein C3orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5S3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q8C5S3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5S3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms