Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TdrpQ8C5P7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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