Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Hdac7Q8C2B3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac7Q8C2B3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac7Q8C2B3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac7Q8C2B3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac7Q8C2B3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac7Q8C2B3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac7Q8C2B3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Hdac7Q8C2B3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Hdac7Q8C2B3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac7Q8C2B3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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