Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8C1R3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8C1R3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms