Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Snx16Q8C080 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Snx16Q8C080 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Snx16Q8C080 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx16Q8C080 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Snx16Q8C080 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx16Q8C080 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Snx16Q8C080 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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