Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Tnfsfm13Q8BXS2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tnfsfm13Q8BXS2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms