Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Iffo1Q8BXL9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Iffo1Q8BXL9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Iffo1Q8BXL9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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