Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ube3dQ8BX13 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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