Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Usp38Q8BW70 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp38Q8BW70 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms