Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Triml1Q8BVP1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Triml1Q8BVP1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms