Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Als2cr12Q8BVM7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Als2cr12Q8BVM7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms