Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pggt1bQ8BUY9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pggt1bQ8BUY9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms