Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rccd1Q8BTU7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rccd1Q8BTU7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms