Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Suds3Q8BR65 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms