Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sfr1Q8BP27 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Sfr1Q8BP27 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sfr1Q8BP27 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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