Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gga3Q8BMI3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gga3Q8BMI3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms