Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smarcal1Q8BJL0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms