Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim23Q8BGX0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim23Q8BGX0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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