Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8BGC1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8BGC1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms