Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cpped1Q8BFS6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms