Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Liat1Q810M6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Liat1Q810M6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Liat1Q810M6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Liat1Q810M6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Liat1Q810M6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms