Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChfrQ810L3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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