Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rbbp8Q80YR6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rbbp8Q80YR6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rbbp8Q80YR6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbbp8Q80YR6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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