Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atg2bQ80XK6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms