Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrde2Q80XC6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms