Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc116Q80X53 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ccdc116Q80X53 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc116Q80X53 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccdc116Q80X53 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc116Q80X53 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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