Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap100Q80VN0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cfap100Q80VN0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms