Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pnma8aQ80VM8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pnma8aQ80VM8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pnma8aQ80VM8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pnma8aQ80VM8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pnma8aQ80VM8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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