Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Actr5Q80US4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Actr5Q80US4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms