Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sgo2Q7TSY8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sgo2Q7TSY8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms