Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clec18aQ7TSQ1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms