Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ckap2lQ7TS74 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms