Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GypcQ78HU7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms