Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SynmQ70IV5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SynmQ70IV5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms