Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2b4Q6Q477 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp2b4Q6Q477 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b4Q6Q477 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2b4Q6Q477 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms