Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NfrkbQ6PIJ4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms