Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf1cQ6PDZ2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Taf1cQ6PDZ2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms