Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms