Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Zbtb40Q6PCS8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Zbtb40Q6PCS8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Zbtb40Q6PCS8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Zbtb40Q6PCS8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Zbtb40Q6PCS8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms