Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smchd1Q6P5D8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smchd1Q6P5D8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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