Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RbfaQ6P3B9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RbfaQ6P3B9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms