Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kdm2bQ6P1G2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kdm2bQ6P1G2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms